As células de Merkel localizam-se na camada basal da epiderme (o local mais profundo da epiderme, onde estão ligadas a terminais nervosos) podendo ser encontradas também na bainha radicular de grandes folículos pilosos.

Ao contrário do melanócito e da célula de Langerhans, esta não é uma célula dentrítica, possuindo tonofilamentos de ceratina e desmossomos ocasionais que a ligam às células adjacentes. Estas células apresentam uma função sensorial. Através das células de Merkel e das terminações nervosas livres presentes na epiderme e também de vários tipos de terminações nervosas presentes na derme, a pele recebe informações do meio ambiente e as envia para o sistema nervoso central.

Possuem formato oval e podem estar em grupos ou isoladas.

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