Lagoas marginais, como o próprio nome sugere, são corpos d’água localizados às margens de rios, compondo o meio físico das planícies de inundação, e podem ser naturais ou artificiais. Estas lagoas são classificadas como sazonais ou permanentes. Normalmente possuem um formato de U.

As lagoas marginais sazonais são corpos d’água que permanecem cheios apenas durante um período determinado do ano, acompanhando o ciclo de cheias dos rios, conhecido cientificamente como pulso de inundação. Estas lagoas se enchem durante o período de cheia, quando as águas do rio principal ultrapassam o nível de suas margens e inundam as planícies de inundação adjacentes.

Quando o nível das águas do rio diminui grande parte da água da planície de inundação volta ao rio ou se concentra em depressões, formando tais lagoas, que secam completamente no período de seca. As lagoas marginais permanentes por outro lado, são corpos d’água que permanecem cheios durante todo o ano, podendo manter ou não comunicação permanente com o rio principal.

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